IF=23.17! | 看环特斑马鱼技术如何助力10余篇高分科研文章发表,助推各类疾病研究!

发布时间:2023-02-24 环特生物 浏览次数:2435

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当前,斑马鱼基因编辑技术在基因敲除、基因敲入、转基因订制及表观遗传修饰等方面的应用日益广泛。环特生物,作为全球斑马鱼技术应用领导者,依托10余年的斑马鱼基因编辑经验,已为200多家单位提供斑马鱼基因敲入、敲除、敲降、定制转基因技术服务及斑马鱼疾病模型开发等专业的基因编辑技术服务,累计完成350例以上基因编辑品系,测试超过1000个gRNA靶点,致力于推动各类基因组研究、研发新的癌症治疗方法、攻克遗传性疾病等,并助力国内外科研工作者们在各类期刊发表了近200篇科研文章。

仅2022年,环特生物又助力10余篇高分(最高IF=23.17)科研文章登顶多家顶级期刊,如Nature Communications、Journal of Hematology & Oncology、Environmental Science & Technology等。本期,我们一起来看2篇由环特生物助力发表的最新高分科研文章~~~

01、影响因子(IF):17.694

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文章题目:《Immunogenetic losses co-occurred with seahorse male pregnancy and mutation in tlx1 accompanied functional asplenia》

发表期刊:Nature communications    

影响因子(IF):17.694

JCR分区:Q1

第一单位:中国科学院南海海洋研究所

DOI: 10.1038/s41467-022-35338-7

文章主题:

在动物界中,海龙科诸多物种“脾脏丢失”这一复杂性状是脊椎动物最为特异的进化特征之一,也是当前国际学术界在鱼类演化领域关注的焦点。中科院南海海洋研究所研究员林强团队历时4年,发现并证实了海马基因单位点突变导致其脾脏缺失的假设,首次提出了海龙科鱼类脾脏缺失与“雄性怀孕”协同进化的新观点。

在脊椎动物中,“雌性怀孕”已经独立进化了150多次,而“雄性怀孕”繁殖系统作为在脊椎动物中的一个全新研究体系,其与免疫系统的协同进化机理仍是未知。研究团队将海马与其他9个不同目的硬骨鱼进行比较基因组学分析,发现海马属中有1260个基因家族显著收缩,涵盖了多个免疫相关通路,如NOD样受体通路、异体移植物排斥反应、抗原处理和呈递等。基因丢失分析也同样支持这一结论。

该研究应用环特斑马鱼基因编辑技术进行了证实。为了证实这一假设,研究团队利用模式物种斑马鱼开展了3次CRISPR/Cas9基因敲除验证。

结果表明,全基因tlx1敲除突变品系斑马鱼全部表现为先天性脾脏丢失;针对海马特异性位点的突变品系斑马鱼亦出现脾脏丢失;相邻位点的突变品系斑马鱼则有完整脾脏。实现了基因单个位点敲除导致整个动物器官丢失的创新性研究,揭示了海马基因tlx1的特异性位点突变(tlx1A208T)调控其脾脏丢失的遗传机制。

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环特贡献:

1. 提供斑马鱼实验平台;

2. 构建了两个tlx1点突变斑马鱼品系,一个tlx1基因敲除斑马鱼品系进行全流程实验验证研究。

02、影响因子(IF):23.17

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文章题目:《Cancer-associated fibroblast-specific lncRNA LINC01614 enhances glutamine uptake in lung adenocarcinoma》

发表期刊:Journal of Hematology & Oncology    

影响因子(IF):23.17

JCR分区:Q1

第一单位:江苏省肿瘤医院(南京医科大学附属肿瘤医院)、江苏省分子与转化型癌症研究重点实验室

DOI: 10.1186/s13045-022-01359-4

文章主题:

该研究基于液体活检早筛技术,通过细胞游离DNA片段组学特征建立斑马鱼模型,该模型在肺癌的筛查预测中展现优异且稳定的性能,用于肺癌早筛敏感性大于80%。

该项研究,共有782个样本,其中非小细胞肺癌432例,健康人350例;其中大于75%的肺癌样本来自早期患者。研究采用机器学习方法,对肿瘤的片段组学特征进行解码和鉴别,建立的斑马鱼模型在训练集、验证队列、独立验证队列中表现出优异性能。斑马鱼模型在不同检测批次间具有极高的筛查稳定性,为临床落地可行性提供支撑。另外,斑马鱼模型对早期肿瘤的预测性能优秀,I期肺癌敏感性达到83.2%,肿瘤小于1cm时预测敏感性达到85%。

通过一些队列的比对研究发现,这种筛查方法,其特异性和准确性达到了90%。这项肺癌早筛查成果发表于国际呼吸学科顶级期刊《Journal of Hematology & Oncology》,就是基于该研究通过细胞游离DNA片段组学特征建立斑马鱼模型,该斑马鱼模型在肺癌的筛查预测中展现优异且稳定的性能。

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环特贡献:

1. 提供斑马鱼实验平台;

2. 构建斑马鱼移植瘤模型,在训练集、验证队列、独立验证队列中表现出优异性能。

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